Agedrup hører til Agedrup Sogn. Agedrup Kirke ligger i bydelens sydøstlige del, som er den oprindelige landsby. Agedrup var allerede vokset sammen med Bullerup i samme sogn til en by, da Agedrup Sognekommune ved kommunalreformen i 1970 blev indlemmet i Odense Kommune. Eftersom Agedrup var en bydel i byen Bullerup, også da den blev en by i Odense Kommune, betragtes Agedrup stadig som en del af Bullerup efter at Danmarks Statistik siden 1. januar 2007 har anset Bullerup for at være en bydel i Odense fordi den er vokset sammen med bydelen Seden og dermed Odense